Исследователи из Университета штата Северная Каролина и сотрудничество фармацевтическими создали бесплатно использовать базу данных из 14000 известно macrolactones — большие молекулы, используемые в области разработки лекарств … который содержит информацию о молекулярных характеристик, химического и биологического разнообразия деятельности данного структурного класса. Базы данных, называется MacrolactoneDB, заполняет пробел в знаниях об этих молекул и может служить полезным инструментом для будущих лекарств.
Macrolactones молекулы, по крайней мере 12 атомов составляющих их кольцевая структура. Среди многих полезных свойств, способность macrolactones’, чтобы привязать к сложным элементам белка делает их подходящими для противовирусных, антибиотиков, противогрибковых и противопаразитарных препаратов. Однако, их размер и сложная структура делают их трудно синтезировать.
«Macrolactones гигантские молекулы, их размер создает проблемы для исследователей, которые хотят работать с ними», — говорит Шон Ekins, генеральный директор партнерств фармацевтика, член НК государства сравнительной медицины Институт, предприниматель в месте жительства в Университете Северной Каролины в Чапел-Хилл Эшельман школа фармации и соответствующие автор исследования. «Мы хотели решить эту проблему путем создания общедоступной базе этих молекул и их свойства».
НК студентка Государственного аспирант и первый автор статьи Фьо Фьо Зин добыто 13 государственных базах данных за 14000 известно macrolactones, скомпилировав их в MacrolactoneDB. Только 20% macrolactone соединений, она куратор у биологических данных, связанных с ними.
Зин, Ekins, и Северная Каролина государственный доцент кафедры химии Гэвин Уильямс провели анализ cheminformatics из macrolactones’ молекулярные свойства и разработаны 91 дескрипторы для более точной характеристики молекулы. Затем исследователи рассмотрели три задачи, представляющие интерес для некоторых macrolactones, в частности малярии, гепатита С и Т-клетки — и используемых методах машинного обучения, чтобы понять структура-активность взаимосвязь между macrolactones и этих целей.
«Мы знаем, что macrolactone препараты эффективны, но есть много мы не знаем о том, что делает хороший друг», — говорит Уильямс. «Вот почему мы решили сделать это исследование. Мы выяснили, что его можно использовать машинное обучение с этими молекулами, и совершенствование анализа и описание macrolactones улучшит моделей прогнозирования в будущем».
«Тех, кто заинтересован в этих молекулах или в разработке лекарственных препаратов с использованием macrolactones теперь имеет дружественный базы данных, где все доступно и в одном месте,» Ekins говорит. «Исследователи могут задать вопросы о том, что делает конкретный macrolactone молекулы хорошо подходит для конкретного биологического применения.
«Надеюсь, MacrolactoneDB поможет нам понять этот многообразный класс молекул, и двигаться вперед в создании новых».
сделать разницу: спонсорские возможности
Ответить
Хотите присоединиться к обсуждению?Не стесняйтесь вносить свой вклад!